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Coronavirus

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SARS-CoV-2 3D virion

Les coronavirus (CoV) sont des virus qui constituent la sous-famille Orthocoronavirinae de la famille Coronaviridae. Le nom « coronavirus », du latin signifiant « virus à couronne », est dû à l'apparence des virions sous un microscope électronique, avec une frange de grandes projections bulbeuses qui évoquent une couronne solaire[2].

Les coronavirus sont munis d'une enveloppe virale incluant une Capside caractérisée par des protéines en forme de massue (dites « protéines de pointe »). Ils ont un génome à ARN monocaténaire (c'est-à-dire à un seul brin), de sens positif (groupe IV de la classification Baltimore), de 26 à 32 kilobases (ce qui en fait les plus grand génomes parmi les virus à ARN)[3]. Ils se classent parmi les Nidovirales, puisque tous les virus de cet ordre produisent un jeu imbriqué d'ARNm sous-génomique lors de l'infection. Des protéines en forme de pointe, une enveloppe, membrane et capside contribuent à la structure d'ensemble de tous les coronavirus. Ils peuvent muter et se recombiner[4].

Les chauves-souris et les oiseaux, en tant que vertébrés volants à sang chaud, seraient les hôtes idéaux pour les coronavirus assurant l'évolution et la dissémination du coronavirus[5]. Les coronavirus sont normalement spécifiques à un taxon animal comme hôte, mammifères ou oiseaux selon leur espèce ; mais ils peuvent parfois changer d'hôte à la suite d'une mutation. Leur transmission interhumaine se produit principalement par contacts étroits via des aérosols respiratoires générées par les éternuements, la toux ou la phonation. Plus de 500 types de coronavirus ont été isolées chez la chauve-souris et il existerait plus de 5 000 types de coronavirus[6].

Sept principaux coronavirus sont généralement cités comme pouvant contaminer l'humain [7]. Un huitième a été identifié : le B814[8] (le premier coronavirus humain identifié), mais cette souche semble ne plus circuler.

Quatre coronavirus en circulation sont considérés comme sources d'infection bénignes : 229E, NL63, OC43 et HKU1. Ils seraient la cause de 15 à 30 % des rhumes courants.

Plus récemment ont été identifiés trois types de coronavirus responsables de graves pneumopathies :

  1. le SARS-CoV, agent pathogène du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) en 2002-2004
  2. le MERS-CoV, celui du syndrome respiratoire du Moyen-Orient à partir de 2012
  3. le SARS-CoV-2, celui de la maladie à coronavirus 2019 (Covid-19) apparue en Chine en 2019 et responsable d'une sévère pandémie en 2020

Découverte, histoire

Illustration de la morphologie des coronavirus. Les péplomères, pointes virales en forme de massue ici colorées en rouge, créent l'apparence d'une couronne entourant le virion, lorsqu'ils sont vus au microscope électronique.

Les coronavirus existent probablement depuis au moins des centaines de millions d'années, mais du point de vue de l'épidémiologie et de l'histoire médicale et en tant que zoonose c'est au XXIe siècle qu'ils ont pris de l'importance : « cinq des sept coronavirus humains ont été isolés au cours de ce siècle. Et malheureusement, les trois derniers sont entrés dans notre vie avec les craintes liées à une épidémie, une pandémie ou à la mort »[9].

C'est en 1930 aux États-Unis que la première maladie due à un coronavirus est observée, chez des volailles. L'année suivante, un médecin décrit dans un article la maladie qui cause une détresse respiratoire chez la poule et une diminution de la ponte et de la qualité des œufs. En 1937 l'agent infectieux, le virus de la bronchite infectieuse aviaire (IBV pour Infectious Bronchitis Virus) est isolé.

En 1946, un autre coronavirus est identifié, le Coronavirus de la gastro-entérite transmissible porcine (TGEV). Indépendamment, en 1949 à New York et 1951 à Londres, deux équipes découvrent le virus de l'hépatite murine chez une souris paralysée [10].

En 1965, le premier coronavirus infectant l'être humain (la souche B814) est découvert. Et rapidement, d'autres suivent : 229E en 1966 et OC43 en 1967[11] qui tous sont la cause de rhumes plus ou moins graves selon les personnes. L'année suivante, ils sont observés au microscope électronique par June Almeida et David Tyrrell qui mettent en évidence leur structure en couronne [12]. La relation est faite entre tous ces virus, et le terme de « coronavirus » est pour la première fois utilisé dans la revue Nature en 1968[2],[10].

Épidémie du XXIe siècle

Pandémie de Coronavirus

Le dernier coronavirus humain (ou récemment humanisé, très probablement à partir d'une ou plusieurs souches portées par des chauves-souris) semble avoir émergé à Wuhan en Chine en 2019 : le SARS-CoV-2. La maladie qu'il cause (COVID-19) a causé en quelques mois la première grande pandémie à coronavirus, caractérisée par un R0 élevé (2,3 en moyenne d'après les estimations disponibles en avril 2020, mais qui semble pouvoir atteindre 5,7) ; avec un taux de létalité de 6,3 (très variable selon les âges et les contextes, pouvant parfois dépasser 15%)[9].

Pandémie de Coronavirus
Pandémie Date Cas confirmés Décès Sous-type impliqué
Épidémie de SRAS de 2002-2004 2002-2004 8 096 774 Sars-Cov (SRAS)
Coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient 2012-2014 361 107 MERS-CoV
Pandémie de Covid-19 (En cours) 2019-2020 + 12 000 000 ()[13] + 545 000 ()[13] SARS-CoV-2 (Covid-19)

Données de la pandémie de Sars-CoV-2 (2019-2020)

 voir • disc. • mod. 
Données de la pandémie de Covid-19 au par pays et territoire

Lieux Confirmés Décès Rétablis % morts par
cas confirmés[a]
Morts pour
100 000 hab.[b]
190 13 066 027
(+ 191 308)
573 039
(+ 3 889)
7 257 244
(+ 140 203)
- -
Drapeau des États-Unis États-Unis[c] 3 363 056
(+ 58 114)
135 605
(+ 400)
1 031 939
(+ 25 613)
4,03 % 41,45
Drapeau du Brésil Brésil 1 884 967
(+ 20 286)
72 833
(+ 733)
1 291 251
(+ 26 408)
3,86 % 34,77
Drapeau de l'Inde Inde 906 752
(+ 28 498)
23 727
(+ 553)
571 460
(+ 17 989)
2,62 % 1,75
Drapeau de la Russie Russie 732 547
(+ 6 511)
11 422
(+ 104)
503 168
(+ 2 960)
1,56 % 7,91
Drapeau du Pérou Pérou 330 123
(+ 3 797)
12 054
(+ 184)
221 008
(+ 3 897)
3,65 % 37,68
Drapeau du Chili Chili 317 657
(+ 2 616)
7 024
(+ 45)
286 556
(+ 2 654)
2,21 % 37,5
Drapeau du Mexique Mexique 304 435
(+ 4 685)
35 491
(+ 485)
240 101
(+ 5 196)
11,66 % 28,12
Drapeau du Royaume-Uni Royaume-Uni[d] 291 691
(+ 537)
44 915
(+ 11)
1 384
(+ 6)
15,4 % 67,55
Drapeau d'Afrique du Sud Afrique du Sud 287 796
(+ 11 554)
4 172
(+ 93)
138 241
(+ 3 367)
1,45 % 7,22
Drapeau de l'Iran Iran 259 652
(+ 2 349)
13 032
(+ 203)
222 539
(+ 2 546)
5,02 % 15,93
Drapeau de l'Espagne Espagne 255 953
(+ 2 045)
28 406
(+ 3)
150 376
(+ 0)
11,1 % 60,8
Drapeau du Pakistan Pakistan 253 604
(+ 1 979)
5 320
(+ 54)
170 656
(+ 8 739)
2,1 % 2,51
Drapeau de l'Italie Italie 243 230
(+ 169)
34 967
(+ 13)
195 106
(+ 178)
14,38 % 57,86
Drapeau de l'Arabie saoudite Arabie saoudite 235 111
(+ 2 852)
2 243
(+ 20)
169 842
(+ 2 704)
0,95 % 6,66
Drapeau de la Turquie Turquie 214 001
(+ 1 008)
5 382
(+ 19)
195 671
(+ 1 156)
2,51 % 6,54
Drapeau de l'Allemagne Allemagne 200 180
(+ 261)
9 074
(+ 3)
185 100
(+ 686)
4,53 % 10,94
Drapeau du Bangladesh Bangladesh 186 894
(+ 3 099)
2 391
(+ 39)
98 317
(+ 4 703)
1,28 % 1,48
Drapeau de la France France[e],[f] 172 377 30 029 78 597 17,42 % 44,83
Drapeau de la Colombie Colombie 150 445
(+ 5 083)
5 634
(+ 208)
63 451
(+ 2 265)
3,74 % 11,35
Drapeau du Canada Canada 109 984
(+ 636)
8 836
(+ 7)
73 381
(+ 427)
8,03 % 23,84
Drapeau du Qatar Qatar 104 016
(+ 418)
149
(+ 2)
100 627
(+ 884)
0,14 % 5,36
Drapeau de l'Argentine Argentine 103 265
(+ 3 099)
1 903
(+ 58)
44 173
(+ 1 479)
1,84 % 4,28
Drapeau de la République populaire de Chine Chine 83 602
(+ 0)
4 634
(+ 0)
78 648
(+ 0)
5,54 % -
Drapeau de l'Égypte Égypte 83 001
(+ 931)
3 935
(+ 77)
24 975
(+ 556)
4,74 % 4,0
Drapeau de l'Irak Irak 79 735
(+ 2 229)
3 250
(+ 100)
46 998
(+ 2 274)
4,08 % 8,46
Drapeau de l'Indonésie Indonésie 76 981
(+ 1 282)
3 656
(+ 50)
36 689
(+ 1 051)
4,75 % 1,37
Drapeau de la Suède Suède 75 826
(+ 928)
5 536
(+ 10)
0
(+ 0)
7,3 % 54,36
Drapeau de l'Équateur Équateur 68 459
(+ 589)
5 063
(+ 16)
30 369
(+ 86)
7,4 % 29,64
Drapeau de la Biélorussie Biélorussie 65 114
(+ 182)
468
(+ 4)
55 492
(+ 112)
0,72 % 4,93
Drapeau de la Belgique Belgique[g] 62 707
(+ 0)
9 782
(+ 0)
17 196
(+ 0)
15,6 % 85,64
Drapeau du Kazakhstan Kazakhstan 61 755
(+ 3 502)
375
(+ 0)
35 911
(+ 2 097)
0,61 % 2,05
Drapeau d'Oman Oman 58 179
(+ 2 164)
259
(+ 2)
37 257
(+ 1 159)
0,45 % 5,36
Drapeau des Philippines Philippines 57 006
(+ 747)
1 599
(+ 65)
20 371
(+ 4 325)
2,8 % 1,5
Drapeau du Koweït Koweït 55 508
(+ 614)
393
(+ 3)
45 356
(+ 746)
0,71 % 9,5
Drapeau de l'Ukraine Ukraine 55 285
(+ 638)
1 415
(+ 15)
27 356
(+ 385)
2,56 % 3,17
Drapeau des Émirats arabes unis Émirats arabes unis 55 198
(+ 344)
334
(+ 1)
45 513
(+ 373)
0,61 % 3,47
Drapeau des Pays-Bas Pays-Bas[h] 51 308
(+ 71)
6 156
(+ 0)
193
(+ 0)
12 % 35,73
Drapeau de la Bolivie Bolivie 49 250
(+ 1 063)
1 866
(+ 59)
15 294
(+ 451)
3,79 % 16,44
Drapeau du Panama Panama 47 173
(+ 1 540)
932
(+ 23)
23 919
(+ 880)
1,98 % 22,31
Drapeau du Portugal Portugal 46 818
(+ 306)
1 662
(+ 2)
31 065
(+ 158)
3,55 % 16,16
Drapeau de Singapour Singapour 46 283
(+ 322)
26
(+ 0)
42 541
(+ 256)
0,06 % 0,46
Drapeau de la République dominicaine République dominicaine 45 506
(+ 974)
903
(+ 6)
22 441
(+ 982)
1,98 % 8,5
Drapeau d’Israël Israël 40 632
(+ 1 962)
365
(+ 3)
19 395
(+ 387)
0,9 % 4,11
Drapeau de la Pologne Pologne 38 190
(+ 299)
1 576
(+ 5)
27 515
(+ 367)
4,13 % 4,15
Drapeau de l'Afghanistan Afghanistan 34 455
(+ 4)
1 012
(+ 2)
21 254
(+ 38)
2,94 % 2,72
Drapeau de Bahreïn Bahreïn 33 476
(+ 535)
109
(+ 1)
29 099
(+ 674)
0,33 % 6,95
Drapeau du Nigeria Nigeria 33 153
(+ 595)
744
(+ 4)
13 671
(+ 224)
2,24 % 0,38
Drapeau de la Roumanie Roumanie 32 948
(+ 413)
1 901
(+ 17)
21 692
(+ 147)
5,77 % 9,76
Drapeau de la Suisse Suisse 32 946
(+ 63)
1 968
(+ 0)
29 600
(+ 0)
5,97 % 23,11
Drapeau de l'Arménie Arménie 32 151
(+ 182)
573
(+ 8)
19 865
(+ 232)
1,78 % 19,41
Drapeau du Guatemala Guatemala 29 742
(+ 387)
1 244
(+ 25)
4 321
(+ 107)
4,18 % 7,21
Drapeau du Honduras Honduras 28 579
(+ 489)
789
(+ 15)
3 123
(+ 166)
2,76 % 8,23
Drapeau de l'Irlande Irlande 25 638
(+ 10)
1 746
(+ 0)
23 364
(+ 0)
6,81 % 35,97
Drapeau du Ghana Ghana 24 988
(+ 470)
139
(+ 0)
21 067
(+ 880)
0,56 % 0,47
Drapeau de l'Azerbaïdjan Azerbaïdjan 24 570
(+ 529)
313
(+ 7)
15 640
(+ 547)
1,27 % 3,15
Drapeau du Japon Japon 22 125
(+ 284)
984
(+ 1)
18 058
(+ 213)
4,45 % 0,78
Drapeau de l'Algérie Algérie 19 689
(+ 494)
1 018
(+ 7)
14 019
(+ 276)
5,17 % 2,41
Drapeau de la Moldavie Moldavie 19 439
(+ 57)
649
(+ 7)
12 793
(+ 126)
3,34 % 18,3
Drapeau de l'Autriche Autriche 18 948
(+ 51)
708
(+ 0)
17 000
(+ 48)
3,74 % 8,0
Drapeau de la Serbie Serbie 18 639
(+ 279)
405
(+ 12)
13 940
(+ 64)
2,17 % 5,8
Drapeau du Népal Népal 16 945
(+ 144)
38
(+ 0)
10 294
(+ 1 705)
0,22 % 0,14
Drapeau du Maroc Maroc 15 936
(+ 191)
255
(+ 5)
12 934
(+ 651)
1,6 % 0,71
Drapeau du Cameroun Cameroun 15 173
(+ 0)
359
(+ 0)
11 928
(+ 0)
2,37 % 1,42
Drapeau de l'Ouzbékistan Ouzbékistan 13 591
(+ 594)
64
(+ 4)
8 030
(+ 178)
0,47 % 0,19
Drapeau de la Corée du Sud Corée du Sud 13 512
(+ 33)
289
(+ 0)
12 282
(+ 78)
2,14 % 0,56
Drapeau du Danemark Danemark[i] 13 238
(+ 91)
610
(+ 1)
12 331
(+ 53)
4,61 % 10,52
Drapeau de la Tchéquie Tchéquie 13 238
(+ 64)
353
(+ 1)
8 373
(+ 126)
2,67 % 3,32
Drapeau de la Côte d'Ivoire Côte d'Ivoire 12 872
(+ 106)
84
(+ 0)
6 810
(+ 156)
0,65 % 0,34
Drapeau du Kirghizistan Kirghizistan 11 444
(+ 327)
149
(+ 2)
3 538
(+ 78)
1,3 % 2,36
Drapeau du Soudan Soudan 10 316
(+ 66)
657
(+ 7)
5 403
(+ 62)
6,37 % 1,57
Drapeau du Kenya Kenya 10 294
(+ 189)
197
(+ 12)
2 946
(+ 65)
1,91 % 0,38
Drapeau de l'Australie Australie 10 251
(+ 271)
108
(+ 0)
7 835
(+ 66)
1,05 % 0,43
Drapeau du Salvador Salvador 9 978
(+ 304)
267
(+ 7)
5 732
(+ 98)
2,68 % 4,16
Drapeau du Venezuela Venezuela 9 707
(+ 242)
93
(+ 4)
2 671
(+ 0)
0,96 % 0,32
Drapeau de la Norvège Norvège 8 984
(+ 3)
253
(+ 1)
8 138
(+ 0)
2,82 % 4,76
Drapeau de la Malaisie Malaisie 8 725
(+ 7)
122
(+ 0)
8 520
(+ 1)
1,4 % 0,39
Drapeau du Sénégal Sénégal 8 198
(+ 63)
150
(+ 2)
5 514
(+ 68)
1,83 % 0,95
Drapeau de la Macédoine du Nord Macédoine du Nord 8 197
(+ 86)
385
(+ 3)
4 326
(+ 123)
4,7 % 18,48
Drapeau de la république démocratique du Congo République démocratique du Congo 8 075
(+ 42)
190
(+ 1)
3 620
(+ 5)
2,35 % 0,23
Drapeau du Costa Rica Costa Rica 8 036
(+ 440)
34
(+ 4)
2 304
(+ 65)
0,42 % 0,68
Drapeau de l'Éthiopie Éthiopie 7 766
(+ 206)
128
(+ 1)
2 430
(+ 0)
1,65 % 0,12
Drapeau de la Bulgarie Bulgarie 7 411
(+ 159)
276
(+ 8)
3 517
(+ 198)
3,72 % 3,93
Drapeau de la Finlande Finlande 7 295
(+ 1)
329
(+ 0)
6 800
(+ 0)
4,51 % 5,96
Drapeau de la Bosnie-Herzégovine Bosnie-Herzégovine 6 981
(+ 104)
226
(+ 5)
3 179
(+ 64)
3,24 % 6,8
Drapeau d'Haïti Haïti 6 727
(+ 0)
141
(+ 2)
3 022
(+ 98)
2,1 % 1,27
Drapeau du Tadjikistan Tadjikistan 6 596
(+ 44)
55
(+ 0)
5 278
(+ 50)
0,83 % 0,6
Drapeau de la Palestine Cisjordanie 6 566
(+ 336)
39
(+ 3)
1 084
(+ 142)
0,59 % 0,85
Drapeau de la Guinée Guinée 6 141
(+ 0)
37
(+ 0)
4 862
(+ 0)
0,6 % 0,3
Drapeau du Gabon Gabon 6 026
(+ 84)
46
(+ 0)
3 475
(+ 471)
0,76 % 2,17
Drapeau de la Mauritanie Mauritanie 5 446
(+ 91)
147
(+ 0)
2 501
(+ 138)
2,7 % 3,34
Drapeau du Kosovo Kosovo 5 118
(+ 187)
108
(+ 6)
2 370
(+ 103)
2,11 % 5,85
Drapeau de Madagascar Madagascar 5 080
(+ 213)
37
(+ 2)
2 494
(+ 116)
0,73 % 0,14
Drapeau de Djibouti Djibouti 4 977
(+ 5)
56
(+ 0)
4 729
(+ 17)
1,13 % 5,84
Drapeau du Luxembourg Luxembourg 4 956
(+ 31)
111
(+ 0)
4 183
(+ 97)
2,24 % 18,26
Drapeau de la République centrafricaine République centrafricaine 4 321
(+ 33)
53
(+ 0)
1 208
(+ 63)
1,23 % 1,14
Drapeau de la Hongrie Hongrie 4 247
(+ 13)
595
(+ 0)
3 073
(+ 37)
14,01 % 6,09
Drapeau de la Grèce Grèce 3 826
(+ 23)
193
(+ 0)
1 374
(+ 0)
5,04 % 1,8
Drapeau de la Croatie Croatie 3 775
(+ 53)
119
(+ 0)
2 514
(+ 28)
3,15 % 2,91
Drapeau de l'Albanie Albanie 3 571
(+ 117)
95
(+ 2)
2 014
(+ 68)
2,66 % 3,31
Drapeau de la Thaïlande Thaïlande 3 220
(+ 3)
58
(+ 0)
3 090
(+ 2)
1,8 % 0,08
Drapeau de la Somalie Somalie 3 072
(+ 13)
93
(+ 0)
1 343
(+ 79)
3,03 % 0,62
Drapeau de la Guinée équatoriale Guinée équatoriale 3 071
(+ 0)
51
(+ 0)
842
(+ 0)
1,66 % 3,9
Drapeau du Paraguay Paraguay 2 980
(+ 32)
25
(+ 3)
1 293
(+ 18)
0,84 % 0,36
Drapeau du Nicaragua Nicaragua 2 846
(+ 0)
91
(+ 0)
1 993
(+ 0)
3,2 % 1,41
Drapeau des Maldives Maldives 2 762
(+ 31)
13
(+ 0)
2 290
(+ 6)
0,47 % 2,52
Drapeau du Sri Lanka Sri Lanka 2 646
(+ 29)
11
(+ 0)
1 981
(+ 0)
0,42 % 0,05
Drapeau du Malawi Malawi 2 430
(+ 66)
39
(+ 1)
747
(+ 190)
1,6 % 0,21
Drapeau de Cuba Cuba 2 428
(+ 2)
87
(+ 0)
2 268
(+ 10)
3,58 % 0,77
Drapeau du Liban Liban 2 419
(+ 85)
36
(+ 0)
1 423
(+ 3)
1,49 % 0,53
Drapeau du Mali Mali 2 412
(+ 1)
121
(+ 0)
1 730
(+ 36)
5,02 % 0,63
Drapeau du Soudan du Sud Soudan du Sud 2 148
(+ 127)
41
(+ 3)
333
(+ 0)
1,91 % 0,37
Drapeau de la république du Congo République du Congo 2 028
(+ 0)
47
(+ 0)
589
(+ 0)
2,32 % 0,9
Drapeau de l'Estonie Estonie 2 014
(+ 0)
69
(+ 0)
1 895
(+ 0)
3,43 % 5,22
Drapeau de la Slovaquie Slovaquie 1 902
(+ 1)
28
(+ 0)
1 493
(+ 0)
1,47 % 0,51
Drapeau de l'Islande Islande 1 900
(+ 4)
10
(+ 0)
1 871
(+ 6)
0,53 % 2,83
Drapeau de la Zambie Zambie 1 895
(+ 0)
42
(+ 0)
1 412
(+ 0)
2,22 % 0,24
Drapeau de la Lituanie Lituanie 1 874
(+ 5)
79
(+ 0)
1 571
(+ 0)
4,22 % 2,83
Drapeau de la Slovénie Slovénie 1 849
(+ 8)
111
(+ 0)
1 473
(+ 4)
6 % 5,37
Drapeau de la Guinée-Bissau Guinée-Bissau 1 842
(+ 0)
26
(+ 0)
773
(+ 0)
1,41 % 1,39
Drapeau du Cap-Vert Cap-Vert 1 698
(+ 75)
19
(+ 0)
748
(+ 0)
1,12 % 3,49
Drapeau de Sierra Leone Sierra Leone 1 642
(+ 7)
63
(+ 0)
1 175
(+ 21)
3,84 % 0,82
Drapeau de la Nouvelle-Zélande Nouvelle-Zélande 1 545
(+ 1)
22
(+ 0)
1 498
(+ 1)
1,42 % 0,45
Drapeau de la Libye Libye 1 512
(+ 79)
40
(+ 1)
367
(+ 26)
2,65 % 0,6
Drapeau du Yémen Yémen 1 498
(+ 33)
424
(+ 7)
675
(+ 16)
28,3 % 1,49
Drapeau de Hong Kong Hong Kong 1 469
(+ 0)
7
(+ 0)
1 214
(+ 0)
0,48 % 0,09
Drapeau de l'Eswatini Eswatini 1 389
(+ 38)
20
(+ 0)
688
(+ 20)
1,44 % 1,46
Drapeau du Bénin Bénin 1 378
(+ 0)
26
(+ 0)
557
(+ 0)
1,89 % 0,23
Drapeau du Rwanda Rwanda 1 378
(+ 41)
4
(+ 0)
710
(+ 26)
0,29 % 0,03
Drapeau de la Tunisie Tunisie 1 302
(+ 39)
50
(+ 0)
1 082
(+ 6)
3,84 % 0,43
Drapeau du Monténégro Monténégro 1 287
(+ 66)
24
(+ 1)
330
(+ 5)
1,86 % 3,86
Drapeau du Mozambique Mozambique 1 219
(+ 62)
9
(+ 0)
369
(+ 5)
0,74 % 0,03
Drapeau de la Jordanie Jordanie 1 183
(+ 4)
10
(+ 0)
1 008
(+ 11)
0,85 % 0,1
Drapeau de la Lettonie Lettonie 1 174
(+ 1)
31
(+ 1)
1 019
(+ 0)
2,64 % 1,61
Drapeau du Niger Niger 1 099
(+ 0)
68
(+ 0)
992
(+ 0)
6,19 % 0,3
Drapeau du Burkina Faso Burkina Faso 1 036
(+ 0)
53
(+ 0)
869
(+ 0)
5,12 % 0,27
Drapeau du Zimbabwe Zimbabwe 1 034
(+ 49)
19
(+ 1)
343
(+ 15)
1,84 % 0,13
Drapeau de l'Ouganda Ouganda 1 029
(+ 4)
0
(+ 0)
977
(+ 5)
0 % 0,0
Drapeau du Libéria Libéria 1 024
(+ 14)
51
(+ 0)
439
(+ 16)
4,98 % 1,06
Drapeau de Chypre Chypre 1 022
(+ 1)
19
(+ 0)
839
(+ 0)
1,86 % 1,6
Drapeau de la Géorgie Géorgie 995
(+ 9)
15
(+ 0)
857
(+ 0)
1,51 % 0,4
Drapeau de l'Uruguay Uruguay 989
(+ 2)
31
(+ 0)
903
(+ 7)
3,13 % 0,9
Drapeau du Tchad Tchad 880
(+ 0)
75
(+ 0)
792
(+ 2)
8,52 % 0,48
Drapeau de la Namibie Namibie 861
(+ 76)
1
(+ 0)
28
(+ 2)
0,12 % 0,04
Drapeau d'Andorre Andorre 858
(+ 3)
52
(+ 0)
803
(+ 0)
6,06 % 67,53
Drapeau du Suriname Suriname 780
(+ 39)
18
(+ 0)
526
(+ 31)
2,31 % 3,13
Drapeau de la Jamaïque Jamaïque 759
(+ 1)
10
(+ 0)
628
(+ 8)
1,32 % 0,34
Drapeau de Sao Tomé-et-Principe Sao Tomé-et-Principe 732
(+ 3)
14
(+ 0)
286
(+ 0)
1,91 % 6,63
Drapeau du Togo Togo 721
(+ 1)
15
(+ 0)
517
(+ 4)
2,08 % 0,19
Diamond Princess 712
(+ 0)
13
(+ 0)
651
(+ 0)
1,83 % -
Drapeau de Saint-Marin Saint-Marin 699
(+ 0)
42
(+ 0)
656
(+ 0)
6,01 % 124,32
Drapeau de Malte Malte 674
(+ 0)
9
(+ 0)
660
(+ 0)
1,34 % 1,86
Drapeau de l'Angola Angola 525
(+ 19)
26
(+ 0)
118
(+ 0)
4,95 % 0,08
Drapeau de la Tanzanie Tanzanie 509
(+ 0)
21
(+ 0)
183
(+ 0)
4,13 % 0,04
Drapeau de Taïwan Taïwan 451
(+ 0)
7
(+ 0)
438
(+ 0)
1,55 % 0,03
Drapeau de la Syrie Syrie 417
(+ 23)
19
(+ 3)
136
(+ 10)
4,56 % 0,11
Drapeau du Botswana Botswana 399
(+ 0)
1
(+ 0)
38
(+ 0)
0,25 % 0,04
Drapeau de la République socialiste du Viêt Nam Viêt Nam 373
(+ 1)
0
(+ 0)
352
(+ 2)
0 % 0,0
Drapeau de Maurice Maurice 342
(+ 0)
10
(+ 0)
330
(+ 0)
2,92 % 0,79
Drapeau de la Birmanie Birmanie 336
(+ 5)
6
(+ 0)
261
(+ 0)
1,79 % 0,01
Drapeau des Comores Comores 317
(+ 0)
7
(+ 0)
296
(+ 0)
2,21 % 0,84
Drapeau du Guyana Guyana 300
(+ 3)
17
(+ 0)
155
(+ 1)
5,67 % 2,18
Drapeau du Burundi Burundi 269
(+ 78)
1
(+ 0)
207
(+ 89)
0,37 % 0,01
Drapeau du Lesotho Lesotho 245
(+ 12)
3
(+ 1)
33
(+ 1)
1,22 % 0,14
Drapeau de la Mongolie Mongolie 243
(+ 13)
0
(+ 0)
204
(+ 1)
0 % 0,0
Drapeau de l'Érythrée Érythrée 232
(+ 0)
0
(+ 0)
107
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau du Cambodge Cambodge 165
(+ 9)
0
(+ 0)
133
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau du Brunei Brunei 141
(+ 0)
3
(+ 0)
138
(+ 0)
2,13 % 0,7
Drapeau de Trinité-et-Tobago Trinité-et-Tobago 133
(+ 0)
8
(+ 0)
124
(+ 4)
6,02 % 0,58
Drapeau des Bahamas Bahamas 113
(+ 2)
11
(+ 0)
91
(+ 2)
9,73 % 2,85
Drapeau de Monaco Monaco 109
(+ 0)
4
(+ 0)
97
(+ 0)
3,67 % 10,34
Drapeau de la Barbade Barbade 103
(+ 0)
7
(+ 0)
90
(+ 0)
6,8 % 2,44
Drapeau des Seychelles Seychelles 100
(+ 0)
0
(+ 0)
11
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau du Bhoutan Bhoutan 84
(+ 0)
0
(+ 0)
76
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau du Liechtenstein Liechtenstein 84
(+ 0)
1
(+ 0)
81
(+ 0)
1,19 % 2,64
Drapeau d'Antigua-et-Barbuda Antigua-et-Barbuda 74
(+ 0)
3
(+ 0)
57
(+ 0)
4,05 % 3,12
Drapeau de la Gambie Gambie 64
(+ 0)
3
(+ 0)
34
(+ 0)
4,69 % 0,13
Drapeau de Macao Macao 46
(+ 0)
0
(+ 0)
45
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau du Belize Belize 37
(+ 0)
2
(+ 0)
20
(+ 0)
5,41 % 0,52
Drapeau de Saint-Vincent-et-les-Grenadines Saint-Vincent-et-les-Grenadines 35
(+ 0)
0
(+ 0)
29
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau des Fidji Fidji 26
(+ 0)
0
(+ 0)
18
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau du Timor oriental Timor oriental 24
(+ 0)
0
(+ 0)
24
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau de Grenade Grenade 23
(+ 0)
0
(+ 0)
23
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau de Sainte-Lucie Sainte-Lucie 22
(+ 0)
0
(+ 0)
19
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau du Laos Laos 19
(+ 0)
0
(+ 0)
19
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau de la Dominique Dominique 18
(+ 0)
0
(+ 0)
18
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau de Saint-Christophe-et-Niévès Saint-Christophe-et-Niévès 17
(+ 0)
0
(+ 0)
15
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau du Vatican Vatican 12
(+ 0)
0
(+ 0)
12
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau de la Papouasie-Nouvelle-Guinée Papouasie-Nouvelle-Guinée 11
(+ 0)
0
(+ 0)
8
(+ 0)
0 % 0,0
Drapeau du Sahara occidental Sahara occidental 10
(+ 0)
1
(+ 0)
8
(+ 0)
10 % 0,18
MS Zaandam 9
(+ 0)
2
(+ 0)
0
(+ 0)
22,22 % -
Données du Center for Systems Science and Engineering de l'université Johns-Hopkins.

Récupérées le à h 0 CEST[14].

Caractérisation

La taxonomie de ces nouveaux virus fait d'abord débat, pour finalement aboutir en 1975 à la création d'une nouvelle famille (Coronaviridae) et d'une nouvelle sous-famille (Orthocoronavirinae) par l'International Committee on Taxonomy of Viruses[10].

Dénomination

Le terme coronavirus (du latin corona et virus, littéralement « virus à couronne »[15]) provient de l'apparence des virions au microscope électronique, caractérisée par une frange de grandes protubérances entourant l'enveloppe avec l'apparence d'une couronne, par analogie avec la couronne solaire[2].

Hôtes du virus

Les hôtes idéaux des coronavirus, en tant que vertébrés volants à sang chaud, sont les chauves-souris (pour les Alphacoronavirus et les Betacoronavirus) et les oiseaux (pour les Gammacoronavirus (en) et les Deltacoronavirus (en)). Ces espèces-réservoir assurent l'évolution et la dissémination des coronavirus[5]. Chez d'autres espèces, les symptômes varient (maladies des voies respiratoires supérieures chez la poule, diarrhée chez la vache ou le porc, des voies digestives chez le chat et le chien, etc.). Parfois, aucun symptôme n'est associé à leur présence (ex. coronavirus du béluga).

L'être humain abrite naturellement quatre types de coronavirus bénins, qui provoquent des infections des voies respiratoires, comme le rhume, et plus rarement affectent les systèmes gastro-intestinaux, cardiaques et nerveux[16].

Les groupes de coronavirus ont normalement un hôte animal spécifique (mammifères ou oiseaux[17]) mais ils peuvent parfois changer d'hôte à la suite d'une mutation. Ce sont de telles mutations qui ont probablement conduit à l'apparition de souches causant de graves infections chez l'homme (SRAS, MERS et Covid-19).

Tropisme

On a longtemps pensé que les coronavirus avaient un tropisme uniquement respiratoire ou gastrointestinal (traduit par des pneumonies et entérocolites dans les cas graves), mais un nombre croissant d'études montrent un tropisme bien plus large, cardiovasculaire notamment, et neurologique également (dès les années 1980, on a montré que plusieurs coronavirus, dont en dernier cas le SARS-CoV-2 sont clairement aussi neuroinvasifs et neurotropes[18],[19],[20], au point que cette diversité de tropismes et de symptômes font des coronavirus (murins notamment, regroupées sous le sigle de MHV) un modèle animal pour l'étude de maladies humaines aussi variées que la sclérose en plaques, l’hépatite virale ou la pneumonie (S. R. Weiss et al. 2011). Le MHV pénètre le Système nerveux central (SNC) via les neurones du nerf olfactif, et peut causer une encéphalite aiguë ou une maladie démyélinisante chronique s'il y persiste (il peut aussi se propager jusqu’à la moelle épinière)[19],[21].

Biologie

Morphologie

Morphologie d'un coronavirus.

Ce virus enveloppé est constitué d'une enveloppe virale entourant une capside hélicoïdale qui contient le brin d'ARN. La taille du génome de ces virus varie d'environ 26 à 32 kilobases, valeurs parmi les plus élevées chez les virus à ARN.

Les coronavirus ont en commun des protéines désignées par une lettre indiquant leur localisation : S (protubérances), E (enveloppe), M (membrane) et N (nucléocapside). Certains, notamment ceux du sous-groupe A du genre Betacoronavirus, ont une protéine HE (hémagglutinine estérase (en)) caractéristique. Le coronavirus du SRAS présente en outre sur la protéine S un site de liaison spécifique à l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2[22] qui lui sert de point d'entrée dans la cellule hôte.

La taille physique du virion est classiquement donnée comme étant de 120 à 160 nm[23] ou comme étant de l'ordre de 125 nm[24]. Toutefois le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19 a été annoncé plus récemment comme mesurant approximativement de 60 à 140 nm, et comme étant de forme elliptique avec de nombreuses variations[25].

Génome

Tous les CoV ont un génome d'ARN non-segmentés (simple brin) organisé de la même manière : les deux tiers environ du génome contiennent deux grands « cadres de lecture ouverts » et se chevauchant (dits ORF1a et ORF1b). Ces deux cadres sont traduits en « polyprotéines réplicase » pp1a et pp1ab. « Ces polyprotéines sont ensuite traitées pour générer 16 protéines non structurales, désignées nsp1 ~ 16. La partie restante du génome contient des ORF pour les protéines structurales, y compris la pointe (S), l'enveloppe (E), la membrane (M) et la nucléoprotéine (N). Un certain nombre de protéines accessoires spécifiques à la lignée sont également codées par différentes lignées de CoV »[3],[26],[27],[28].

Réplication

Réplication du virus à couronne.

Elle se fait en six étapes successives (voir illustration) :

  1. Grâce à leur protéine S, les coronavirus se lient aux molécules cellulaires de surface telles que les métalloprotéinases. Les virus dotés en plus de la protéine HE (hémagglutinine-estérase) dans leur enveloppe peuvent aussi se lier à l'acide N-acétylneuraminique qui sert de corécepteur (lui-même initiateur de l'entrée d'un pathogène dans une cellule hôte). On ne sait pas clairement si les virus entrent dans la cellule hôte par fusion des membranes virales et cellulaires, ou par une internalisation à récepteur. Quel qu’en soit le mécanisme, le brin d'ARN est inséré dans la cellule, et la capside (la coque) est abandonnée ;
  2. Les coronavirus sont munis d'un seul génome ARN à brin positif, à présent sur place dans le cytoplasme. Le génome de l'ARN du coronavirus a une coiffe méthylée 5' et une queue polyadénylée 3', ce qui permet à l'ARN de se fixer aux ribosomes pour la traduction. Les ribosomes de la cellule décodent l'ARN viral, produisant les protéines qui y sont codées ;
  3. D'abord l'ARN positif du virus est transcrit en protéine pour former une ARN polymérase propre (une ARN polymérase ARN-dépendante). La réplicase est la première protéine fabriquée ; une fois le gène codant la réplicase traduit par le ribosome de la cellule hôte, la traduction est arrêtée par un codon stop. Cette réplicase virale ne reconnaît et produit que l'ARN viral, et permet au génome viral d'être transcrit en nouvelles copies d'ARN, à l'aide de la machinerie de la cellule hôte. Se servant du brin positif comme modèle, cet enzyme assemble le brin négatif ;
  4. Par la suite, ce brin négatif sert lui-même de modèle pour transcrire de petits ARN sous-génomiques, qui sont utilisés pour fabriquer toutes les autres protéines. C'est ce qu'on appelle une transcription imbriquée. Ce processus est une forme d'économie génétique, permettant au virus de coder le plus grand nombre de gènes dans un petit nombre de nucléotides ;
    Le génome du brin négatif est traduit par le ribosome de la cellule hôte, et une longue polyprotéine est formée, où toutes les protéines virales sont attachées. Les coronavirus ont une protéine non structurale - une protéase - qui est capable de cliver la polyprotéine.
    Par ailleurs, ce brin négatif joue un rôle dans la réplication de nouveaux génomes ARN à brin positif.
    Le cytoplasme de la cellule hôte se remplit de protéines et d'ARN viraux ;
  5. (a) La protéine N aide à lier l'ARN génomique pour réaliser l’encapsidation du génome virale dans une enveloppe protectrice nommée capside[29] ; la protéine M s'intègre à la membrane du réticulum endoplasmique, côté capside ; et des protéines HE et S traversent la membrane du réticulum endoplasmique, via la protéine de translocation, et se positionnent du côté opposé.
    (b) Avec la liaison entre la capside et les protéines M, la membrane du réticulum s'invagine, et bourgeonne. La capside (la coque) assemblée dotée d'ARN hélicoïdal se retrouve alors à l'intérieur du réticulum endoplasmique, ayant capturé à son profit la membrane de ce dernier, qui porte à présent à son extérieur les protéines HE et S ;
  6. Cette progéniture virale est ensuite (a) encapsulée et transportée par des vésicules golgiennes vers la membrane cellulaire, (b) pour être enfin externalisée (par exocytose) hors de la cellule.

Infection à coronavirus

Types d'infection

Sept types de coronavirus infectent couramment l'homme[30], dont trois causent des infections graves.

Infections bénignes

Les quatre premiers types connus sont sans gravité : les coronavirus humains 229E, NL63, OC43 et HKU1, inconnus chez la chauve-souris. Ils causent des rhumes avec fièvre et des maux de gorge dus à des végétations adénoïdes gonflées, principalement en hiver et au début du printemps[31].

Les coronavirus seraient la cause de 15 à 30 % des rhumes courants[32].

Infections graves

Trois types de coronavirus qui ne se trouvent pas naturellement chez l'homme mais chez des mammifères ont été découverts plus récemment et ont été à l'origine d'infections graves des poumons (pneumopathie virale) :

Selon le virus en cause, les formes graves de la maladie ont leurs particularités. Par exemple, la diarrhée était très fréquente dans le SRAS mais rare dans la maladie à coronavirus 2019.

Comparaison des infections graves

Trois principales sources sont utilisées : l'Institut Pasteur, l'OMS et les CDC américains[34].

Syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS)[35],[36] Syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS)[37],[38],[39] Maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)
Agent pathogène MERS-CoV SARS-CoV SARS-CoV-2
Année d'apparition 2012 2003 2019
Nombre de cas 1 219 8 098 dont 5 327 en Chine. En cours, voir ici
Pourcentage de cas par transmission nosocomiale 70 %[40] 58 %[40]
Nombre de décès 449 774 (dont 349 en Chine) En cours, voir ici
Réservoir Dromadaire Chauve-souris Chauve-souris (probablement)
Transmission à l'homme par l'animal Contact direct avec un animal infecté, consommation de lait cru de dromadaire. Consommation de viande de civette palmiste masquée, animal sauvage vendu sur les marchés et consommé dans le Sud de la Chine. Un pangolin[33] pourrait être l'hôte intermédiaire.
Transmission interhumaine Oui Oui Oui
Transmission par objet Oui Risque très faible.
Transmission materno-fœtale Aucun cas retrouvé chez les femmes enceintes infectées par ce virus[41]. Aucune preuve[42].
Transmission par le lait maternel Un seul cas documenté[43] RT-PCR négative sur 16 femmes testées[44]
Incubation Entre 5 et 15 jours. Entre 2 et 7 jours. Durée médiane d'incubation à 5,1 jours (5,5 jours en moyenne), 97,5 % des personnes seront malades 11,5 jours après le contact infectieux[45].
Porteur sain Probablement pas. Oui, (un seul cas publié)
Contagiosité Taux de reproduction inférieur à 1[46]. Taux de reproduction supérieur à 2[46]. Médiane du taux de reproduction de base (R0) à 2,79[47].
Durée de la contagiosité Semble limitée à la période des signes cliniques. Possibilité disputée de contagion en phase asymptomatique[48].
Début de la période de contagiosité 3 à 4 jours après le début des signes cliniques. Dès l'apparition des signes cliniques. Porteur asymptomatique prouvé[49].
Fièvre À 98% À 99% À 87.9%, mais peut apparaître plusieurs jours après la toux ou les difficultés à respirer.
Diarrhée À 26% À 20%[41]. À 3.7%.
Transmission par les selles Très probable mais a joué un rôle mineur[41]. Cette possibilité est envisagée[50].
Létalité 34,4 %[40] 9,5 %[40], au-delà de 50 % chez les plus de 65 ans. 3,4 %[51]
Traitement Symptomatique Symptomatique Symptomatique
Vaccin Aucun Aucun Aucun
Statut Résurgence possible. Considéré comme éradiqué. Épidémie en cours.

Passage de la barrière des espèces

Au vu des séquences génomiques disponibles, deux grands taxons animaux seraient le réservoir principal des CoVs :

Au vu des connaissances disponibles, les coronavirus semblaient avoir besoin d'hôtes intermédiaires (toujours des mammifères) pour s'« humaniser », c'est-à-dire muter pour pouvoir infecter l'Homme.
Des hôtes intermédiaires connus ont été :

Transmission interhumaine

Pour la pandémie de 2019-2020, se reporter aux articles dont les noms suivent.

Particules éjectées par un éternuement.

La transmission interhumaine des coronavirus se fait principalement par les gouttelettes ou des aérosols respiratoires expectorées par une personne infectée (via la toux, les éternuements, des postillons, ou parfois par le simple fait de parler fort ou en criant) quand les particules virales sont inhalées par une personne se trouve à proximité. La transmission et la contagiosité varient aussi selon le coronavirus, et peut-être selon sa souche au sein d'une épidémie.

La prophylaxie passe par une prévention primaire visant à limiter la transmission du virus : éviter les contacts (surfaces potentiellement contaminées, poignées de main, embrassades), se laver les mains fréquemment, éviter de se toucher les yeux, le nez ou la bouche, par où le virus peut s'introduire dans l'organisme. En cas de symptômes de type toux ou rhume, se maintenir à au moins 1 mètre de toute personne et éviter d'émettre des particules contaminées[53].

D'autres recommandations comprennent[54] :

  • ne pas entrer en contact avec des animaux manifestement malades, ne pas consommer de viandes provenant d'animaux malades ;
  • ne pas consommer de produits animaux (viande...) mal cuits, ni de légumes crus s'ils n'ont pas été lavés avec de l'eau non contaminée.

Traitement

Dans le cas du SRAS, des médicaments ont été utilisés pour tenter d'enrayer l'épidémie : la ribavirine, un analogue de nucléotides, des anti-inflammatoires stéroïdiens et, après identification formelle de l'agent pathogène et des criblages de sensibilité, l'interféron-alpha et des inhibiteurs de protéases. Leur efficacité est encore sujette à caution. Aucun n'a fait l'objet d'une étude clinique adéquate : beaucoup d'études disponibles ne permettent pas de conclusions scientifiques claires car elles ont été réalisées sur de petits nombres de sujets ou alors sans protocole ou dose fixe. Certaines indiquent même que ces traitements pourraient avoir nui à l'éradication du virus[55].

Vaccins

L'éradication rapide de l'épidémie de SRAS précédente n'a pas laissé place à beaucoup d'essais cliniques. Des vaccins à base de virus inactivé, et d'autres fondés sur les protéines S et N, sont à l'étude depuis plusieurs années[56].

Taxonomie

Nommage des coronavirus

Les coronavirus sont nommés par un groupe d'étude[57] travaillant au sein de l'ICTV (International committee on Taxonomy of viruses)[58].

Classification

Les coronavirus (CoV) sont des virus à ARN monocaténaire de sens positif (groupe IV de la classification Baltimore) correspondant à la sous-famille Orthocoronavirinae de la taxonomie de l'ICTV[1], dans la famille Coronaviridae, et de l'ordre Nidovirales[59],[60].

Selon les caractéristiques de leurs séquences protéiques, les CoV sont classés en 4 genres (alpha-CoV, beta-CoV, gamma-CoV et delta-CoV), qui tous contiennent des virus pathogènes pour les mammifères[4] :

  1. Alphacoronavirus, qui inclut le virus de la diarrhée épidémique porcine (PEDv), le virus de la gastro-entérite transmissible porcine (TGEV), le coronavirus du syndrome de la diarrhée aiguë porcine (SADS-CoV), le coronavirus canin, le coronavirus entérique félin, le virus de la péritonite infectieuse féline (FIPV) ;
  2. Betacoronavirus, dont le virus respiratoire-respiratoire du SRAS (SARS-CoV), le SARS-CoV-2, le coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV), virus de l'hépatite murine (MHV), coronavirus bovins, virus de la sialodacryoadénite du rat, virus de la sialodacryoadénite porcine, hémagglutinose porcine, virus de l'hémagglutinose porcine coronavirus équin. Dans ce genre Betacoronavirus, le SARS-CoV et le SARS-CoV-2 appartiennent tous les deux au sous-genre Sarbecovirus au sein duquel trois clades distincts ont été identifiés :
    - Clade1: souches "chauve-souris" de Bulgarie et Kenya[61] ;
    - Clade2: SARS-CoV-2 et souches "chauve-souris" de Chine orientale[61] ;
    - Clade3: SARS-CoV et souches "chauves-souris" de Chine du sud-ouest[61] :
  3. Gammacoronavirus: surtout trouvé chez des oiseaux migrateurs, causant notamment des bronchites ; un Gammacoronavirus a été isolé d'un béluga en captivité,
  4. Deltacoronavirus: connus depuis peu, qui semblent surtout infecter les oiseaux, mais aussi trouvé chez les porcs.

Remarques :

  • On a parfois nommé un coronavirus selon l'espèce animale où il a d'abord été trouvé (par exemple : coronavirus respiratoire canin, ou CRCoV pour Canine respiratory coronavirus, virus appartenant au genre betacoronavirus et à son sous-groupe 2a)[62],[63].
  • Le dernier coronavirus trouvé, en 2019, est le SARS-CoV-2, responsable de la pandémie de COVID-19.

Liste des espèces

La sous-famille Orthocoronavirinae de la famille Coronaviridae est organisée en 4 genres, 22 sous-genres et une quarantaine d'espèces[64] :


Notes

  1. Cette donnée est à considérer avec précaution, puisque la politique de test n'est pas la même d'un pays à un autre.
  2. Populations pour l'année 2018, données recupérées de la Banque mondiale (source) et chiffres vérifiables sur le Coronavirus Resource Center l'université Johns-Hopkin (source).
  3. Sont inclus les cas recensés à Porto Rico et aux îles Vierges des États-Unis.
  4. Sont inclus les cas recensés à Anguilla, aux Bermudes, à Gibraltar, aux îles Anglo-Normandes, aux îles Caïmans, aux îles Turques-et-Caïques, aux îles Vierges britanniques, dans l'île de Man et à Montserrat.
  5. Sont inclus les cas recensés en Guadeloupe, en Guyane, à La Réunion, en Martinique, à Mayotte, en Nouvelle-Calédonie, en Polynésie française, à Saint-Barthélémy, à Saint-Martin et à Saint-Pierre-et-Miquelon.
  6. L'université Johns-Hopkins additionnant les cas confirmés et probables, les données de Santé publique France sont utilisées pour la France (source).
  7. Le total des décès enregistrés au se répartissent comme suit: 57 % sont survenus en milieu hospitalier, 40 % en maisons de soins et de repos (sans test de confirmation), 1 % au domicile du patient et pour 2 %, l'information n'est pas disponible selon Sciensano.
  8. Sont inclus les cas recensés à Aruba, à Curaçao et à Saint-Martin.
  9. Sont inclus les cas recensés au Groenland et dans les îles Féroé.

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Voir aussi

Sur les autres projets Wikimedia :

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Infographie

Articles connexes

Liens externes


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